Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms