Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms