Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms