Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms