Protein–RNA interactions for Protein: P04259

KRT6B, Keratin, type II cytoskeletal 6B, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6BP04259 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6BP04259 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6BP04259 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6BP04259 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6BP04259 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6BP04259 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6BP04259 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6BP04259 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6BP04259 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6BP04259 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6BP04259 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6BP04259 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6BP04259 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6BP04259 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6BP04259 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6BP04259 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6BP04259 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT6BP04259 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT6BP04259 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT6BP04259 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT6BP04259 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT6BP04259 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT6BP04259 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT6BP04259 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT6BP04259 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT6BP04259 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT6BP04259 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT6BP04259 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT6BP04259 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT6BP04259 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT6BP04259 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT6BP04259 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT6BP04259 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT6BP04259 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT6BP04259 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT6BP04259 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT6BP04259 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT6BP04259 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT6BP04259 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT6BP04259 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT6BP04259 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT6BP04259 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6BP04259 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms