Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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