Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMUO75648 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMUO75648 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMUO75648 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMUO75648 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMUO75648 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMUO75648 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMUO75648 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMUO75648 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMUO75648 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMUO75648 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMUO75648 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMUO75648 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMUO75648 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMUO75648 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMUO75648 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMUO75648 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMUO75648 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMUO75648 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMUO75648 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMUO75648 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMUO75648 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMUO75648 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMUO75648 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMUO75648 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMUO75648 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMUO75648 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMUO75648 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMUO75648 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMUO75648 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMUO75648 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMUO75648 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMUO75648 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMUO75648 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMUO75648 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMUO75648 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMUO75648 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMUO75648 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMUO75648 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMUO75648 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMUO75648 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMUO75648 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMUO75648 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMUO75648 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMUO75648 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMUO75648 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMUO75648 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMUO75648 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMUO75648 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMUO75648 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRMUO75648 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRMUO75648 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRMUO75648 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRMUO75648 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRMUO75648 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRMUO75648 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMUO75648 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMUO75648 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMUO75648 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMUO75648 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMUO75648 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMUO75648 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMUO75648 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMUO75648 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMUO75648 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMUO75648 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMUO75648 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMUO75648 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMUO75648 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMUO75648 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMUO75648 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMUO75648 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMUO75648 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMUO75648 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMUO75648 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMUO75648 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMUO75648 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMUO75648 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMUO75648 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMUO75648 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMUO75648 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMUO75648 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMUO75648 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMUO75648 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMUO75648 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMUO75648 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMUO75648 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMUO75648 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMUO75648 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMUO75648 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMUO75648 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMUO75648 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMUO75648 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMUO75648 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMUO75648 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMUO75648 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMUO75648 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMUO75648 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMUO75648 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRMUO75648 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms