Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms