Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
H7C1D1 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H7C1D1 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
H7C1D1 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
H7C1D1 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
H7C1D1 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
H7C1D1 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
H7C1D1 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
H7C1D1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
H7C1D1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
H7C1D1 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
H7C1D1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H7C1D1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H7C1D1 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
H7C1D1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H7C1D1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
H7C1D1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
H7C1D1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H7C1D1 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
H7C1D1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H7C1D1 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H7C1D1 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
H7C1D1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H7C1D1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H7C1D1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H7C1D1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H7C1D1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H7C1D1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H7C1D1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H7C1D1 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H7C1D1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H7C1D1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H7C1D1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H7C1D1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H7C1D1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H7C1D1 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H7C1D1 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H7C1D1 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H7C1D1 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H7C1D1 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H7C1D1 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
H7C1D1 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H7C1D1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H7C1D1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H7C1D1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H7C1D1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H7C1D1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H7C1D1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H7C1D1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H7C1D1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H7C1D1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H7C1D1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H7C1D1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H7C1D1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H7C1D1 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H7C1D1 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H7C1D1 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H7C1D1 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H7C1D1 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
H7C1D1 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H7C1D1 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H7C1D1 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H7C1D1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H7C1D1 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
H7C1D1 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
H7C1D1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H7C1D1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H7C1D1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H7C1D1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H7C1D1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H7C1D1 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H7C1D1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H7C1D1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H7C1D1 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H7C1D1 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H7C1D1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H7C1D1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
H7C1D1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
H7C1D1 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H7C1D1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H7C1D1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H7C1D1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
H7C1D1 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H7C1D1 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H7C1D1 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H7C1D1 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H7C1D1 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
H7C1D1 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
H7C1D1 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
H7C1D1 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
H7C1D1 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
H7C1D1 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
H7C1D1 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
H7C1D1 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
H7C1D1 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H7C1D1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
H7C1D1 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
H7C1D1 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
H7C1D1 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
H7C1D1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194.4 ms