Protein–RNA interactions for Protein: H3BML4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BML4 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3BML4 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3BML4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3BML4 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3BML4 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3BML4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3BML4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3BML4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3BML4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3BML4 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3BML4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3BML4 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3BML4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3BML4 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3BML4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3BML4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3BML4 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3BML4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3BML4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3BML4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3BML4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3BML4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H3BML4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BML4 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BML4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BML4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BML4 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BML4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BML4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BML4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BML4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BML4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BML4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BML4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BML4 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BML4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BML4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BML4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BML4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BML4 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BML4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BML4 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BML4 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BML4 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BML4 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BML4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BML4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BML4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BML4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BML4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BML4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BML4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BML4 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BML4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BML4 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BML4 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BML4 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BML4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BML4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BML4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BML4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BML4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BML4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BML4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BML4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BML4 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BML4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BML4 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BML4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BML4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BML4 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BML4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BML4 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BML4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BML4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BML4 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BML4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BML4 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BML4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BML4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BML4 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BML4 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BML4 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BML4 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BML4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BML4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BML4 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BML4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BML4 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BML4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BML4 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BML4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BML4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BML4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BML4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BML4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BML4 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BML4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BML4 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BML4 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms