Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms