Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms