Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2P4

SLC27A6, Long-chain fatty acid transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A6Q9Y2P4 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC27A6Q9Y2P4 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms