Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms