Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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USP18Q9UMW8 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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USP18Q9UMW8 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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USP18Q9UMW8 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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USP18Q9UMW8 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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USP18Q9UMW8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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USP18Q9UMW8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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USP18Q9UMW8 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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USP18Q9UMW8 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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USP18Q9UMW8 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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USP18Q9UMW8 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
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