Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms