Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CGGBP1Q9UFW8 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CGGBP1Q9UFW8 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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