Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVK13-1Q9NX77 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVK13-1Q9NX77 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVK13-1Q9NX77 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVK13-1Q9NX77 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVK13-1Q9NX77 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVK13-1Q9NX77 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVK13-1Q9NX77 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVK13-1Q9NX77 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVK13-1Q9NX77 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVK13-1Q9NX77 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVK13-1Q9NX77 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVK13-1Q9NX77 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVK13-1Q9NX77 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVK13-1Q9NX77 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVK13-1Q9NX77 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVK13-1Q9NX77 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVK13-1Q9NX77 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVK13-1Q9NX77 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVK13-1Q9NX77 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVK13-1Q9NX77 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVK13-1Q9NX77 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVK13-1Q9NX77 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVK13-1Q9NX77 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVK13-1Q9NX77 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVK13-1Q9NX77 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms