Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms