Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.05■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.05■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.05■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.05■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KIAA1549Q9HCM3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms