Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms