Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms