Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC4A5Q9BY07 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms