Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms