Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HINFPQ9BQA5 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms