Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCLRE1CQ96SD1 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCLRE1CQ96SD1 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCLRE1CQ96SD1 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCLRE1CQ96SD1 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCLRE1CQ96SD1 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCLRE1CQ96SD1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCLRE1CQ96SD1 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCLRE1CQ96SD1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCLRE1CQ96SD1 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DCLRE1CQ96SD1 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCLRE1CQ96SD1 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCLRE1CQ96SD1 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCLRE1CQ96SD1 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCLRE1CQ96SD1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCLRE1CQ96SD1 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCLRE1CQ96SD1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DCLRE1CQ96SD1 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCLRE1CQ96SD1 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DCLRE1CQ96SD1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCLRE1CQ96SD1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCLRE1CQ96SD1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCLRE1CQ96SD1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCLRE1CQ96SD1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCLRE1CQ96SD1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCLRE1CQ96SD1 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCLRE1CQ96SD1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCLRE1CQ96SD1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCLRE1CQ96SD1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCLRE1CQ96SD1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCLRE1CQ96SD1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCLRE1CQ96SD1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCLRE1CQ96SD1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DCLRE1CQ96SD1 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCLRE1CQ96SD1 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCLRE1CQ96SD1 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCLRE1CQ96SD1 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCLRE1CQ96SD1 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCLRE1CQ96SD1 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCLRE1CQ96SD1 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCLRE1CQ96SD1 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCLRE1CQ96SD1 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCLRE1CQ96SD1 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCLRE1CQ96SD1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCLRE1CQ96SD1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCLRE1CQ96SD1 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCLRE1CQ96SD1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCLRE1CQ96SD1 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms