Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPNS2Q96L46 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms