Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIRT1Q96EB6 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms