Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms