Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms