Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM4

PRAMEF8, PRAME family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF8Q5VWM4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms