Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms