Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBAP2Q5T6F2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms