Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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