Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

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Length 1,122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPP1R3AQ16821 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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