Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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NDUFA9Q16795 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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NDUFA9Q16795 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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NDUFA9Q16795 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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