Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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