Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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NPTX1Q15818 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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