Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCOA1Q15788 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
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