Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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