Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms