Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

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Length 614 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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NCOA4Q13772 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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NCOA4Q13772 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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NCOA4Q13772 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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NCOA4Q13772 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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NCOA4Q13772 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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NCOA4Q13772 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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NCOA4Q13772 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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