Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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