Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms