Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
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