Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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