Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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