Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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