Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms