Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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SYCNQ0VAF6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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SYCNQ0VAF6 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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SYCNQ0VAF6 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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